Η συγκεκριμένη εργασία έχει τη δυναμική να οδηγήσει σε νέες θεραπείες και να επιταχύνει την έρευνα σε τεχνητά σχεδιασμένα κύτταρα. Ο Jef Boeke, βιολόγος στο NYU Langone Health, που είχε πρόσβαση στην έρευνα πριν τη δημοσίευσή της, τόνισε πως τα αποτελέσματα της AI ήταν εντυπωσιακά και απρόβλεπτα. «Εντοπίστηκαν ιοί με νέα γονίδια, περικομμένα γονίδια και διαφορετικές διατάξεις», αναφέρει χαρακτηριστικά.

Παρά τα εντυπωσιακά ευρήματα, δεν πρόκειται ακόμη για πλήρως σχεδιασμένη ζωή από AI, καθώς οι ιοί δεν θεωρούνται ζωντανοί οργανισμοί αλλά τμήματα γενετικού κώδικα με απλά γονιδιώματα.

Οι ερευνητές του Arc Institute εστίασαν στη δημιουργία παραλλαγών ενός βακτηριοφάγου ιού, του phiX174, ο οποίος διαθέτει μόλις 11 γονίδια και περίπου 5.000 γράμματα DNA. Για τον σκοπό αυτό χρησιμοποίησαν δύο εκδοχές της AI Evo, που βασίζεται στις ίδιες αρχές με μεγάλα γλωσσικά μοντέλα όπως το ChatGPT. Αντί για κείμενα, οι ερευνητές εκπαίδευσαν τα μοντέλα σε γενώματα περίπου 2 εκατομμυρίων άλλων βακτηριοφάγων.

Για να αξιολογήσουν αν οι προτάσεις του AI είχαν νόημα, τύπωσαν χημικά 302 σχέδια γενωμάτων ως αλυσίδες DNA και τα ανέμειξαν με βακτήρια E. coli. Η στιγμή-ορόσημο ήρθε όταν παρατήρησαν περιοχές νεκρών βακτηρίων στα τρυβλία τους – ένδειξη ότι οι ιοί που δημιούργησε η AI ήταν λειτουργικοί. Μάλιστα, φωτογράφισαν τα σωματίδια των ιών στο μικροσκόπιο, τα οποία εμφανίζονταν ως θολές κουκκίδες.

Συνολικά, 16 από τα 302 σχέδια αποδείχθηκαν επιτυχή: οι υπολογιστικά σχεδιασμένοι φάγοι μπόρεσαν να αναπαραχθούν και να καταστρέψουν τα βακτήρια.

Ταχύτητα και προοπτικές της τεχνητής νοημοσύνης στη βιολογία

Ο J. Craig Venter, γνωστός για τη δημιουργία των πρώτων οργανισμών με συνθετικό DNA πριν περίπου είκοσι χρόνια, χαρακτήρισε τις μεθόδους AI ως «μια πιο γρήγορη εκδοχή πειραμάτων δοκιμής-σφάλματος». Θύμισε ότι όταν η δική του ομάδα δημιούργησε βακτήριο με εργαστηριακά εκτυπωμένο γονιδίωμα το 2008, χρειάστηκαν πολυάριθμες δοκιμές και χειρωνακτική ανάλυση της βιβλιογραφίας.

Η ταχύτητα είναι ο λόγος που πολλοί επενδύουν στην τεχνητή νοημοσύνη για να μεταμορφώσει τη βιολογία. Ήδη μέσα στο 2024, νέες μέθοδοι AI τιμήθηκαν με Nobel για την πρόβλεψη της δομής πρωτεϊνών, ενώ δισεκατομμύρια επενδύονται στην ανάπτυξη φαρμάκων μέσω AI. Αυτή την εβδομάδα η εταιρεία Lila στη Βοστώνη συγκέντρωσε 235 εκατ. δολάρια για αυτοματοποιημένα εργαστήρια με τεχνητή νοημοσύνη.

Οι ιοί που σχεδιάζονται από υπολογιστές θα μπορούσαν να αξιοποιηθούν εμπορικά. Για παράδειγμα, οι γιατροί εφαρμόζουν κατά διαστήματα «θεραπεία φάγων» σε ασθενείς με βαριές βακτηριακές λοιμώξεις, ενώ παρόμοιες δοκιμές γίνονται στη γεωργία για την αντιμετώπιση ασθενειών όπως η μαύρη σήψη στο λάχανο.

«Υπάρχει σίγουρα μεγάλο δυναμικό σε αυτή την τεχνολογία», σημειώνει ο φοιτητής Samuel King, επικεφαλής του έργου στο εργαστήριο του Brian Hie. Υπογραμμίζει πως οι περισσότερες γονιδιακές θεραπείες βασίζονται σε ιούς ως φορείς μεταφοράς γονιδίων στον ανθρώπινο οργανισμό—και η AI θα μπορούσε να τους καταστήσει αποτελεσματικότερους.

Ανησυχίες για τη βιοασφάλεια και τα όρια της τεχνολογίας

Οι ερευνητές του Στάνφορντ διαβεβαιώνουν ότι δεν εκπαίδευσαν την AI σε ιούς που προσβάλλουν ανθρώπους. Ωστόσο, η ίδια τεχνολογία ενέχει τον κίνδυνο κάποιοι επιστήμονες—από περιέργεια ή κακή πρόθεση—να χρησιμοποιήσουν τις μεθόδους αυτές σε παθογόνα επικίνδυνα για τον άνθρωπο.

«Συνιστώ μεγάλη προσοχή σε οποιαδήποτε έρευνα ενίσχυσης ιών, ιδίως όταν είναι τυχαία και άγνωστης έκβασης», προειδοποιεί ο Venter. «Αν κάποιος εφαρμόσει αυτή την τεχνική στην ευλογιά ή τον άνθρακα, θα ανησυχούσα σοβαρά.»

Παραμένει ανοιχτό το ερώτημα αν η τεχνητή νοημοσύνη μπορεί να δημιουργήσει πλήρες γονιδίωμα μεγαλύτερων οργανισμών. Για παράδειγμα, το E. coli διαθέτει περίπου χίλιες φορές περισσότερο γενετικό υλικό από το phiX174. «Η πολυπλοκότητα θα εκτινασσόταν σε επίπεδα πολύ πάνω από τον αριθμό των υποατομικών σωματιδίων στο σύμπαν», σχολιάζει ο Boeke.

Επιπλέον, δεν υπάρχει ακόμη εύκολος τρόπος να δοκιμαστούν σχεδιάσεις AI για μεγάλα γονιδιώματα. Ενώ κάποιοι ιοί μπορούν να “ενεργοποιηθούν” απλά από ένα μόριο DNA, αυτό δεν ισχύει για βακτήρια ή πολυκύτταρους οργανισμούς όπως ο άνθρωπος—θα απαιτούνταν σταδιακές γενετικές τροποποιήσεις ενός υπάρχοντος κυττάρου, μια διαδικασία που παραμένει επίπονη.

Παρά τις δυσκολίες αυτές, ο διευθύνων σύμβουλος της Ginkgo Bioworks στη Βοστώνη, Jason Kelly, πιστεύει ότι ένα τέτοιο εγχείρημα είναι απαραίτητο και μπορεί να υλοποιηθεί σε αυτοματοποιημένα εργαστήρια όπου τα γενώματα προτείνονται, δοκιμάζονται και τα αποτελέσματα τροφοδοτούνται πίσω στην AI για περαιτέρω βελτίωση. «Θα ήταν ένα επιστημονικό ορόσημο εθνικής κλίμακας—καθώς τα κύτταρα είναι τα δομικά στοιχεία κάθε ζωής», τονίζει ο Kelly. «Οι ΗΠΑ πρέπει να διασφαλίσουν ότι θα προηγηθούν.»

Διαβάστε το αρχικό άρθρο εδώ.

Ο ομογενής γιατρός, που έχει επικριθεί ουκ ολίγες φορές για τις επιστημονικές του τεκμηριώσεις επειδή δεν συνάδουν με το κυρίαρχο κυβερνητικό αφήγημα, κρούει τον κώδωνα του κινδύνου και ζητά να ληφθούν σοβαρά μέτρα για την προστασία του πληθυσμού, έστω και αυτή την ύστατη στιγμή.

«Αν και ελπίζω να αλλάξουμε πορεία στην Ελλάδα, έστω και τώρα, κάνοντας σοβαρή επιδημιολογική επιτήρηση και πιο μαζικά τεστ και προφυλάσσοντας καλύτερα τα γηροκομεία και τους ευπαθείς πληθυσμούς, υπάρχει δυστυχώς η πιθανότητα να συνεχίσουμε ανοχύρωτοι. Οπότε, ως τα τέλη Φεβρουαρίου μπορεί να έχουμε ήδη φτάσει σε 5.000 έως 10.000 θανάτους, αν όχι περισσότερους, και να έχουμε μολυσμένο πάνω από το 20% του ελληνικού πληθυσμού, με ακόμα μεγαλύτερα ποσοστά στη βόρεια Ελλάδα!» προειδοποιεί ο κ. Ιωαννίδης και συνεχίζει:

• «Δεν ξέρω πόσο ακριβώς θα μπορεί να προσφέρει πλέον ένα εμβόλιο, αν φτάσουμε σε αυτή τη φάση… Μπορεί να είναι αργά. Το απεύχομαι, φυσικά».

Και ενώ η χώρα μας απολάμβανε τα εγκωμιαστικά σχόλια από τον διεθνή Τύπο για την επιτυχή διαχείριση του πρώτου κύματος της πανδημίας, χθες στη Θεσσαλονίκη άνοιξαν ομαδικοί τάφοι για τα θύματα του κορωνοϊού, καθώς τα κοιμητήρια της περιοχής δεν έχουν άλλο χώρο!

«Θα γίνει η Θεσσαλονίκη το νέο Μπέργκαμο;» αναρωτιούνται πολλοί το τελευταίο διάστημα, καθώς η κατάσταση τείνει να γίνεται χειρότερη, παρότι συμπληρώθηκε ένας ολόκληρος μήνας καραντίνας στην πόλη.

Όπως εξηγεί ο δρ Ιωαννίδης, η χαώδης κατάσταση που επικρατεί στη βόρεια Ελλάδα είναι συνδυασμός πολλών παραγόντων, ένας εκ των οποίων είναι η αθρόα προσέλευση ταξιδιωτών από τις βαλκανικές χώρες χωρίς κανέναν έλεγχο.

• «Πολλά μολυσμένα άτομα, ειδικά από βαλκανικές χώρες που είχαν στηρίξει το ίδιο ολέθριο αφήγημα όπως η Ελλάδα, δηλαδή δεν έκαναν τεστ, δεν έβλεπαν κρούσματα και νόμιζαν ότι είναι όλα μια χαρά, ήρθαν στη χώρα και ειδικά στη βόρεια Ελλάδα. Ο συνωστισμός συνεχίστηκε αμείωτος σε πολλές περιστάσεις, ειδικά μάλιστα στα μέσα μαζικής μεταφοράς τα οποία δεν αποσυμφορήθηκαν. Τηλεργασία χρησιμοποιήθηκε ελάχιστα. Τεστ συνέχισαν να γίνονται ελάχιστα. Συστηματική επιδημιολογική επιτήρηση δεν υπήρξε ποτέ, για να προλάβουμε νωρίς τις νέες εξάρσεις. Επίσης, η βόρεια Ελλάδα είχε νωρίτερα από τη νότια χειμωνιάτικες συνθήκες που ευνόησαν τη διάδοση», σημειώνει, τονίζοντας πως, με εξαίρεση τη μικρότερη εισροή μολυσμένων ατόμων από βαλκανικές χώρες και τον καιρό, οι άλλοι παράγοντες ισχύουν και για τη νότια Ελλάδα.

«Αυτό σημαίνει ότι υπάρχει κίνδυνος να πάνε τα πράγματα πιο άσχημα και στη νότια Ελλάδα, καθώς μπαίνουμε στον χειμώνα. Η πανδημία φυσικά είναι απρόβλεπτη, απλώς εμείς πρέπει να είμαστε ψύχραιμοι και έτοιμοι» τονίζει με νόημα.

«Χάσαμε το τρένο των ελάχιστων θανάτων, μπορούν να γίνουν διορθωτικές κινήσεις»

Όπως επισημαίνει ο καθηγητής του Στάνφορντ, έστω και τώρα μπορούν να γίνουν διορθωτικές κινήσεις, οι οποίες θα πρέπει να περιλαμβάνουν πρώτα απ’ όλα την επιδημιολογική επιτήρηση και την εντατική χρήση των τεστ, καθώς, σε διαφορετική περίπτωση, ο ιός μένει αθέατος και διαδίδεται ταχύτατα.

• «Χάσαμε ήδη το τρένο των ελάχιστων θανάτων, κάτι που πρόλαβαν με μαζικό έλεγχο και χρήση τεστ η Σιγκαπούρη, η Ταϊβάν και η Νότια Κορέα. Αλλά, έστω και τώρα, συγκρίνετε την Κύπρο με την Ελλάδα: Έχει εννιά φορές μικρότερο πληθυσμό, αλλά κάνει σχεδόν τον ίδιο αριθμό τεστ όσο και η τόσο πολυπληθέστερη Ελλάδα» λέει και προσθέτει το παράδειγμα της Σλοβακίας, η οποία ήλεγξε με τεστ το 60% του πληθυσμού της μέσα σε ένα Σαββατοκύριακο!

«Ως τις 14 Νοεμβρίου Ελλάδα και Σλοβακία είχαν τον ίδιο αριθμό θανάτων. Μεταξύ 15 και 30 Νοεμβρίου, όταν αρχίζει να φαίνεται η αποτελεσματικότητα της μαζικής παρέμβασης τεστ, η Σλοβακία είχε 329 θανάτους έναντι 1.071 στην Ελλάδα, μείωση κατά περίπου 40%». Πολύ σημαντικό μέτρο είναι ακόμη κατά τον δρα Ιωαννίδη η δρακόντεια προστασία γηροκομείων και νοσοκομείων με τη διενέργεια τεστ κάθε εβδομάδα για όλο το προσωπικό και τους τροφίμους.

«Επίσης, ένα 10% του πληθυσμού πρέπει να αποφεύγει αχρείαστες εκθέσεις πολύ πιο αυστηρά, ενώ εξίσου σημαντική είναι και η αποσυμφόρηση των μέσων μαζικής μεταφοράς, με περισσότερα δρομολόγια και με περισσότερα οχήματα».

Ο ελληνικής καταγωγής επιστήμονας τονίζει τη σημασία της τηλεργασίας στην αναχαίτιση της πανδημίας, αλλά και τη μεταφορά της μάχης στην πρωτοβάθμια φροντίδα. «Οι περισσότεροι δεν χρειάζεται να πάνε στο νοσοκομείο, πρέπει να αντιμετωπιστούν από την πρωτοβάθμια φροντίδα υγείας. Αν μολυνθούν τα νοσοκομεία, προκαλούνται καταστρεπτικές νοσοκομειακές λοιμώξεις» εξηγεί υπογραμμίζοντας την ανάγκη επίταξης του ιδιωτικού τομέα, εφόσον δεν επαρκούν οι ΜΕΘ των δημόσιων νοσοκομείων.

«Αντιθέτως, τα μέτρα οριζόντιου απαγορευτικού χαρακτήρα δεν βοηθούν. Το να κλείνεις τους ανθρώπους για περισσότερο χρόνο κάθε μέρα σε κλειστό χώρο για μια λοίμωξη που διαδίδεται κυρίως σε κλειστό χώρο είναι παράλογο! Πρέπει να μεγιστοποιηθεί η χρήση ανοιχτών χώρων, με την προϋπόθεση ότι αποφεύγονται οι αχρείαστες εκθέσεις σε άγνωστα άτομα. Δεν είναι, δυστυχώς, παράδοξο ότι συνεχίζουμε με μεγάλους καθημερινούς αριθμούς θανάτων, παρά το ήδη παρατεταμένο lockdown» καταλήγει.

Πηγή: εφημερίδα Δημοκρατία

Ο έλεγχος ανίχνευσης αντισωμάτων από την ερευνητική ομάδα του Έλληνα καθηγητή της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου Στάνφορντ Γιάννη Ιωαννίδη σε δείγμα 3.300 ατόμων, σταθμισμένο για να αντιπροσωπεύει τον γενικό πληθυσμό της επαρχίας Σάντα Κλάρα της Καλιφόρνια, επιβεβαίωσε τις υποψίες ότι η εξάπλωση της νόσου Covid-19 είναι πολύ μεγαλύτερη από ό,τι δείχνουν τα επίσημα στατιστικά των επιβεβαιωμένων κρουσμάτων, κάτι που εκτιμάται ότι συμβαίνει σε όλες τις χώρες.

Η μελέτη, στην οποία χρησιμοποιήθηκαν γρήγορα τεστ αντισωμάτων της αμερικανικής εταιρείας βιοτεχνολογίας Premier Biotech, δείχνει ότι στη συγκεκριμένη περιοχή τα πραγματικά κρούσματα είναι 50 έως 85 φορές περισσότερα. Εκτιμάται ότι 48.000 έως 82.000 άνθρωποι από τους περίπου δύο εκατομμύρια κατοίκους είχαν μολυνθεί με τον κορωνοϊό και όχι 1.000 που ήσαν τα επιβεβαιωμένα κρούσματα στη Σάντα Κλάρα στις αρχές Απριλίου.

Σύμφωνα με τον κ. Ιωαννίδη, «το κύριο μήνυμα είναι ότι η λοίμωξη φαίνεται να είναι 50 έως 85 φορές συχνότερη στην περιοχή από ό,τι δείχνουν τα καταγεγραμμένα περιστατικά, άρα και η θνητότητα είναι 50-85 φορές μικρότερη από ό,τι νομίζαμε μέχρι σήμερα.

Νομίζω ότι είναι τα καλύτερα δυνατά νέα και φαίνεται να συμφωνούν με προ-ανακοινώσεις άλλων μελετών επιπολασμού από Ιταλία, Γερμανία, Ολλανδία, Δανία και μελέτες καθολικής διαλογής σε άστεγους στη Βοστώνη (36% θετικοί, όλοι ασυμπτωματικοί), καθώς και σε γυναίκες που πήγαν πριν τρεις εβδομάδες να γεννήσουν σε δυο νοσοκομεία στη Νέα Υόρκη (15% θετικές, σχεδόν όλες ασυμπτωματικές). ‘Αρα η θνητότητα της λοίμωξης Covid-19 είναι πολύ κοντά στο 0,1% της γρίπης, αν και φυσικά μπορεί να είναι σαφώς μεγαλύτερη, όταν ένα σύστημα υγείας καταρρέει και δεν μπορεί να φροντίσει ασθενείς, όπως πχ στο Κουίνς ή στο Μπέργκαμο».

Ο ίδιος ανέφερε ότι «μακάρι να υπάρξουν δεδομένα και από την Ελλάδα. Αν πρέπει να κάνω μια εικασία, ο πιθανός αριθμός ατόμων που έχουν μολυνθεί στην Ελλάδα, είναι κάπου 100.000-200.000, ίσως και μεγαλύτερος, με κάθε επιφύλαξη βέβαια, καθώς χρειαζόμαστε πραγματικά δεδομένα ειδικά από την Ελλάδα για να ξέρουμε με μεγαλύτερη σιγουριά».

Είχε προηγηθεί τον Απρίλιο μια γερμανική έρευνα τεστ αντισωμάτων σε 500 από τους 12.000 κατοίκους της μικρής πόλης Γκάνγκελτ, στην οποία είχε γίνει μια λαϊκή γιορτή τον Φεβρουάριο, βρίσκοντας ότι ο ένας στους επτά που ελέγχθηκαν (14%), είχε αντισώματα, ενώ ακόμη ένα 2% βρέθηκε θετικό σε μοριακά διαγνωστικά τεστ. Το τοπικό ποσοστό θνητότητας υπολογίστηκε μόλις στο 0,37%, έναντι 3% σε όλη τη Γερμανία με βάση τα επιβεβαιωμένα κρούσματα.

Το γερμανικό Ινστιτούτο Ρόμπερτ Κοχ σκοπεύει να κάνει τεστ αντισωμάτων σε αντιπροσωπευτικό δείγμα 15.000 ατόμων του πληθυσμού της χώρας. Ήδη ξεκίνησε κατ’ οίκον η μεγαλύτερη έως τώρα τυχαία δειγματοληψία σε 3.000 νοικοκυριά στο Μόναχο, ενώ και άλλες χώρες ενδιαφέρονται να μιμηθούν το γερμανικό πρωτόκολλο, σύμφωνα με τους «Τάιμς της Νέας Υόρκης».

Είχε προηγηθεί τον Απρίλιο μια γερμανική έρευνα τεστ αντισωμάτων σε 500 από τους 12.000 κατοίκους της μικρής πόλης Γκάνγκελτ, στην οποία είχε γίνει μια λαϊκή γιορτή τον Φεβρουάριο, βρίσκοντας ότι ο ένας στους επτά που ελέγχθηκαν (14%), είχε αντισώματα, ενώ ακόμη ένα 2% βρέθηκε θετικό σε μοριακά διαγνωστικά τεστ. Το τοπικό ποσοστό θνητότητας υπολογίστηκε μόλις στο 0,37%, έναντι 3% σε όλη τη Γερμανία με βάση τα επιβεβαιωμένα κρούσματα.

Το γερμανικό Ινστιτούτο Ρόμπερτ Κοχ σκοπεύει να κάνει τεστ αντισωμάτων σε αντιπροσωπευτικό δείγμα 15.000 ατόμων του πληθυσμού της χώρας. Ήδη ξεκίνησε κατ’ οίκον η μεγαλύτερη έως τώρα τυχαία δειγματοληψία σε 3.000 νοικοκυριά στο Μόναχο, ενώ και άλλες χώρες ενδιαφέρονται να μιμηθούν το γερμανικό πρωτόκολλο, σύμφωνα με τους «Τάιμς της Νέας Υόρκης».

Οπως αναφέρει το ΑΠΕ-ΜΠΕ, αντίστοιχες δειγματοληπτικές έρευνες οροεπιπολασμού του πληθυσμού μέσω αντισωμάτων βρίσκονται ήδη σε εξέλιξη σε Κίνα, Ν. Κορέα, Αυστραλία, Ιταλία, Ισλανδία, ΗΠΑ κά.